当前干细胞主要临床应用于：治疗、保健、美容这三个方面，亦会用于一些难治性疾病的改善。

研究表明，经过定向诱导分化的干细胞，能再生梗死的心脏细胞，会让心脏重新充满活力。干细胞还能令心脏功能保持健康状态，不因年龄增长而出现衰退，损害情况。

随着年龄增大，凋亡和衰老的脑细胞越来越多，导致大脑功能衰退。而在机体内输注一定量的通过诱导分化成脑细胞的干细胞，可取代衰老凋亡的脑细胞，改善记忆力，提高思维能力，能有效地防止老年痴呆症的发生。

通过干细胞治疗肝硬化，能根据周围微环境分化成新的肝脏功能细胞。一方面能“催醒”自身肝脏细胞“再生”；另一方面可以修复和营养受损的细胞。互相综合作用，能修复和替代机体已经发生病变的细胞，使患者肝脏功能逐渐得到恢复，干预治疗效果显著。

通过干细胞治疗，经定向诱导分化的免疫细胞作用于机体的免疫功能系统，能让机体的抵抗力增强，细菌感染和病毒感染的几率下降。使被病毒感染的细胞和肿瘤细胞被破坏或凋亡，起到既保护自身正常细胞，又可杀伤肿瘤、病毒细胞的作用。

利用干细胞治疗卵巢早衰，可恢复卵巢功能；促进受损组织的自身修复；对受损卵巢起到保护作用；直达损伤部位，分化成部分血管内皮细胞，提供营养支持；改善卵巢促卵泡激素微环境，恢复损伤卵巢的功能；防止卵泡闭锁，促进卵泡更新，从而增强生殖能力。

通过干细胞治疗，可以靶向修复生殖系统的衰老退化，恢复或增强性功能；年轻体壮没有性功能障碍的人，通过干细胞治疗则可保持良好性能力的同时，促进性激素平衡，减少夜尿次数，改善前列腺增生症状。并对男性的生殖系统起到预防保健效果，使其不易出现前列腺肥大等症状。

随着年龄的增大，人体的肌肉功能日渐减弱甚至消失，肌肉的力量与紧张度，肌肉张弛功能等都会下降，身体会逐渐臃肿。通过干细胞的治疗，能改善肌肉功能、增加力量、改善体型、使人更显年轻态。